Noworodek pochodzi ze sterylnego środowiska, ale gdy przechodzi przez kanał rodny i wchodzi w kontakt ze światem zewnętrznym, zaczyna być kolonizowany przez różne mikroorganizmy, które stopniowo tworzą jego mikrobiotę lub florę jelitową. Ta mikrobiota ma ogromne znaczenie, ponieważ zdrowie przez całe jej życie będzie w dużej mierze zależeć od jej różnorodności i funkcjonalności. Bakterie obecne w jelicie są związane z rozwojem układu odpornościowego, chronią przed chorobami jelit, infekcjami i różnymi patologiami.
Mikrobiota nie jest taka sama u wszystkich noworodków. Zależy to od rodzaju porodu (cięcie pochwowe lub cesarskie), rodzaju karmienia (karmienie piersią lub butelka), tygodni ciąży, leków matki lub dziecka itp.
W dochodzeniu przeprowadzonym przez naukowca z Wyższej Rady Badań Naukowych (CSIC) zostały one zbadane wpływ podania antybiotyków podczas porodu na mikroflorę jelitową urodzonych drogą pochwową niemowląt urodzonych o czasie. Wyniki sugerują, że ta dość powszechna praktyka może sprzyjać kolonizacji przez patogenne bakterie, które niosą geny oporności na te antybiotyki.
Podawanie antybiotyków matce podczas porodu jest dość powszechną praktyką (około 30% przypadków). Jest stosowany profilaktycznie, gdy matka ma pozytywny wynik w analizie paciorkowca, rodzaju bakterii, które w normalnych warunkach nie powodują uszkodzeń, ale jeśli dotrą do płuc, mogą mieć poważne konsekwencje dla noworodka. We wcześniejszych badaniach zauważono już, że podawanie antybiotyków powoduje zmiany w mikrobiocie wcześniaków. W następstwie ostatnich badań wyniki te zostały ekstrapolowane na dzieci urodzone o czasie. Według Miguela Gueimonde, jednego z badaczy CSIC, na szczególną uwagę zasługuje wpływ antybiotykoterapii na florę jelitową oraz możliwość pojawienia się bakterii niosących oporne geny.
Zespół badaczy, w tym naukowcy z Centralnego Szpitala Uniwersyteckiego w Asturii i Uniwersytetu w Parmie (Włochy), przeanalizował próbki kału od 40 noworodków urodzonych o czasie z porodu drogami natury. Spośród nich 18 urodziło się podczas porodów, podczas których matce podawano penicylinę w ramach profilaktyki przeciwbakteryjnej.
Obserwacja została przeprowadzona w pierwszych trzech miesiącach życia dzieci i, między innymi, a spadek liczby bakterii rodzinnych bifidobakterie których obecność jest korzystna dla organizmu. Zaobserwowano również wzrost liczby potencjalnie patogennych i opornych bakterii z rodzajów Campylobacter lub Helicobacter.
Według naukowców badanie nie ma na celu zakończenia praktyki podawania antybiotyków, ale aby ostrzec przed skutkami wtórnymi i położyć podwaliny pod ustanowienie strategii mających na celu korygowanie tych zmian, sprzyjających kolonizacji i ustanowieniu mikroflory jelitowej noworodka.