Một đứa trẻ sơ sinh đến từ một môi trường vô trùng, nhưng khi nó đi qua ống sinh và tiếp xúc với thế giới bên ngoài, nó bắt đầu bị các vi sinh vật khác nhau xâm chiếm, từng chút một sẽ tạo thành hệ vi sinh vật hoặc hệ vi khuẩn đường ruột của nó. Hệ vi sinh vật này cực kỳ quan trọng vì sự đa dạng và chức năng của nó sẽ phụ thuộc phần lớn vào sức khỏe trong suốt cuộc đời của nó. Các vi khuẩn hiện diện trong ruột có liên quan đến sự phát triển của hệ thống miễn dịch, chúng bảo vệ chống lại các bệnh đường ruột, nhiễm trùng và các bệnh lý khác nhau.
Hệ vi sinh vật không giống nhau ở tất cả trẻ sơ sinh. Điều này thay đổi tùy thuộc vào hình thức sinh (âm đạo hoặc sinh mổ), hình thức cho con bú (bú mẹ hoặc bú bình), tuần thai, thuốc của mẹ hoặc con, v.v.
Trong một cuộc điều tra được thực hiện bởi một nhà khoa học từ Hội đồng Nghiên cứu Khoa học Cấp cao (CSIC), chúng đã được nghiên cứu ảnh hưởng của việc sử dụng thuốc kháng sinh trong khi sinh lên hệ vi sinh vật đường ruột của trẻ sinh đủ tháng qua đường âm đạo. Kết quả cho thấy rằng thực tế khá phổ biến này có thể tạo điều kiện thuận lợi cho sự xâm chiếm của vi khuẩn gây bệnh mang gen kháng những loại kháng sinh này.
Sử dụng thuốc kháng sinh cho người mẹ trong khi sinh con là một thực tế khá phổ biến (khoảng 30% trường hợp). Nó được sử dụng để dự phòng khi người mẹ dương tính với phân tích liên cầu, một loại vi khuẩn không gây tổn thương trong điều kiện bình thường nhưng nếu nó đến phổi, có thể gây hậu quả nghiêm trọng cho trẻ sơ sinh. Trong các nghiên cứu trước đây, người ta đã thấy rằng việc sử dụng kháng sinh gây ra những thay đổi trong hệ vi sinh vật của trẻ sinh non. Theo nghiên cứu gần đây, những kết quả này đã được ngoại suy cho trẻ sinh đủ tháng. Theo Miguel Gueimonde, một trong những nhà nghiên cứu CSIC, tác động của liệu pháp kháng sinh lên hệ vi khuẩn đường ruột và khả năng xuất hiện của vi khuẩn mang gen kháng thuốc đáng được quan tâm đặc biệt.
Nhóm các nhà nghiên cứu, bao gồm các nhà khoa học từ Bệnh viện Đại học Trung ương Asturias và Đại học Parma (Ý), đã phân tích mẫu phân của 40 trẻ đủ tháng bằng phương pháp sinh ngả âm đạo. Trong số này, 18 đứa trẻ được sinh ra trong những ca sinh nở mà người mẹ được dùng penicillin để dự phòng kháng khuẩn.
Việc theo dõi được thực hiện trong ba tháng đầu đời của trẻ sơ sinh và, trong số các kết quả khác, giảm vi khuẩn gia đình Họ Bifidobacteriaceae mà sự hiện diện có lợi cho cơ thể. Tương tự, sự gia tăng các vi khuẩn có khả năng gây bệnh và kháng thuốc thuộc các giống Campylobacter hoặc Helicobacter đã được quan sát thấy.
Theo các nhà điều tra, nghiên cứu không tìm cách kết thúc việc sử dụng thuốc kháng sinh, nhưng để cảnh báo về những tác động thứ cấp và đặt nền tảng cho việc thiết lập các chiến lược nhằm khắc phục những thay đổi này, tạo điều kiện thuận lợi cho việc xâm chiếm và thiết lập hệ vi sinh vật đường ruột của trẻ sơ sinh.